1.通常来讲，倘若夫妻感情不和，并且分居时长达到了二年，在经过调解依旧无效之后，法院通常会判决准予离婚。
这里有一个关键要点，那就是男方不同意分居两年这一事实，必须要有足够充分的证据来予以证明，像分居协议这类书面材料，或者是证人所提供的证言等。
倘若仅仅是其中一方主张存在分居情况，然而另一方予以否认，并且也没有其他任何证据来加以佐证的话，那么就很可能难以对分居事实进行认定。
2.另外，法院在判决离婚时，并不是仅仅依据分居两年这一个条件，还需要综合全面地考虑夫妻之间的感情是否确实已经破裂等诸多因素。
假如男方虽然不同意分居两年，但却存在其他一些会导致夫妻感情破裂的情形，例如重婚行为、实施家暴行为、对另一方进行虐待等，在这种情况下，法院也有很大可能会判决离婚。
3.总而言之，仅仅是分居了两年，并且男方不同意的这种情形，并不一定就能够判决离婚，而是需要根据具体的案件实际情况进行综合全面的判断。
案情回顾:
小朱和小李是夫妻，小朱向法院起诉离婚称已分居两年，但小李不同意分居两年这一事实。小朱未能提供分居协议等书面材料，也无证人证言。不过小朱指出小李存在重婚行为。法院需综合判定是否准予离婚。
案情分析:
1、小朱主张分居两年，因无证据且小李否认，此分居事实难认定。
2、虽分居两年事实难认定，但小朱指出小李重婚，这是导致夫妻感情破裂的情形。法院判决离婚时会综合考虑多种因素，即使分居两年事实存疑，小李重婚情况若属实，法院也很可能判决离婚。