当第二次离婚起诉时，如果对方不出庭，法院是可以依法进行缺席判决的。
根据《民事诉讼法》的相关规定，要是被告被传票传唤了，却没有正当理由拒不到庭，或者未经法庭许可就中途退庭了，那法院就可以进行缺席判决。
在这种情况下，法院会仔细地根据原告提供的各种证据，以及在庭审过程中的实际情况来进行审理和作出判决。
不过，被告不出庭确实可能会对他自己的权益产生一些影响，就像他没办法充分地表达自己的意见之类的。
所以，原告一定要尽可能地把证据准备得充分些，像婚姻关系的证明，感情破裂的事实等等，这样就能增加自己胜诉的可能性。
同时，法院也会始终依法保障被告的合法权益，绝对会确保整个审判程序是公正且合法的。
这样既保障了原告的权益，也不让被告的合法权益受到损害，能让离婚案件得到一个合理的处理。