关于房屋实测面积与约定面积存在显著差异的处理方法如下：若实测面积超出合约面积，其中介于合约面积的3%区间内的部分需由购房者予以补足；而超过此范围的额外部分则由出售方负担。另一方面，若实测面积较合约面积低出，那么出售方可依据实测面积间的差异值进行赔偿。

《确定土地所有权和使用权的若干限定》第五十六条土地所有权或使用权证明文件上的四至界线与实地一致，但实地表积与准许面积不一致的，按实地四至界线计量土地表积，确定土地的所有权或使用权。