针对农村房屋产权纠纷问题，具体的处理方案包括以下几个方面：首先，可以由涉事双方当事人自行协商确定如何妥善解决纷争；其次，若协商无果，可选择向县级及以上级别地方人民政府土地管理部门提出申诉，请求其从中协调解决，同时，县级及以上级别地方人民政府土地管理部门有权勒令侵权方立即停止侵害行为，并对受害方进行相应的经济赔偿；最后，若前述两种途径均未能有效解决争议，则可通过民事诉讼程序来寻求法律救济。在产权调换房屋的选址和面积、搬迁费用、征收部门与被征收人依据相关法规就补偿方式、补偿金额以及支付方式等重要事项达成一致意见之后，若有任何一方当事人不愿意履行所签订的协议义务，另一方当事人便可依法提起诉讼。此外，还需明确过渡方式和过渡期限等细节问题。

《中华人民共和国土地管理法》第六十二条农村村民一户只能拥有一处宅基地，其宅基地的面积不得超过省、自治区、直辖市规定的标准。人均土地少、不能保障一户拥有一处宅基地的地区，县级人民政府在充分尊重农村村民意愿的基础上，可以采取措施，按照省、自治区、直辖市规定的标准保障农村村民实现户有所居。农村村民建住宅，应当符合乡（镇）土地利用总体规划、村庄规划，不得占用永久基本农田，并尽量使用原有的宅基地和村内空闲地。编制乡（镇）土地利用总体规划、村庄规划应当统筹并合理安排宅基地用地，改善农村村民居住环境和条件。农村村民住宅用地，由乡（镇）人民政府审核批准；其中，涉及占用农用地的，依照本法第四十四条的规定办理审批手续。农村村民出卖、出租、赠与住宅后，再申请宅基地的，不予批准。国家允许进城落户的农村村民依法自愿有偿退出宅基地，鼓励农村集体经济组织及其成员盘活利用闲置宅基地和闲置住宅。国务院农业农村主管部门负责全国农村宅基地改革和管理有关工作。