对于合同纠纷案件的妥善处理，可采取如下几种方法作为参考：1、首先，可以选择通过双方协商来化解矛盾；2、其次，可寻求第三方介入，进行公正的调解以求达到共识；3、若各方对协商和调解都表示不愿意接受或无法达成共识时，可依据合伙协议内所规定的仲裁条款或在事后经各方同意后达成的书面仲裁协议，向指定的仲裁机构提起仲裁程序。4、如果在合伙协议中并未制定仲裁条款，或者在事后也未能形成书面仲裁协议书，那么我们也可以选择向当地有管辖权的人民法院提起诉讼，请求判决和审理。

《民法典》第二百三十三条
物权受到侵害的，权利人可以通过和解、调解、仲裁、诉讼等途径解决。