关于房产证办下来后能否约定份额的问题，具体情况如下：
一、一般情况
房产证办下来后，原则上难以再约定份额。
房产证作为房屋所有权的法定证明，具有很强的法律效力。
一旦办理完成，意味着房屋的所有权归属以及各所有权人所占份额通常已明确确定，受到法律的保护，一般不允许随意更改。
二、特殊情况
在某些特殊情形下，若存在合法的协议或法律依据，可通过协商一致来变更份额。
例如夫妻婚后共同购房，若想约定各自份额，最好在办理房产证之前或同时，以书面协议的形式进行约定。
因为之后再进行约定，不仅可能面临法律风险，比如可能不符合相关法律规定，导致约定无效；而且程序也较为复杂，涉及到诸多手续和流程。
总之，房产证办下来后约定份额存在难度，需谨慎对待，若有相关需求，最好咨询专业律师，确保行为合法合规。

案情回顾:

小朱和小李婚后共同购房，房产证已办理下来。后来小朱想与小李约定各自对房屋的份额，小李却认为房产证办下来后不能再约定份额，双方因此产生争议。

案情分析:

1、一般情况下，房产证办下来后，其作为房屋所有权法定证明，效力很强。房屋所有权归属及各所有权人份额已明确，受法律保护，通常不允许随意更改，所以小李的观点有一定道理。
2、特殊情形下，若有合法协议或法律依据，经协商一致可变更份额。但小朱和小李此时约定，可能面临法律风险，且程序复杂，涉及诸多手续流程。