法院判决确认房屋所有权人是有效的，具体原因阐述如下：
1.法定效力层面：
法院的生效判决具备既判力与执行力。
既判力意味着一旦法院对房屋所有权归属作出判决，当事人就不能再就同一事项反复争议。
例如，在某房屋所有权纠纷案件中，法院已判定房屋归甲所有，那么甲和其他相关方就不能再就该房屋的所有权问题重新挑起争端。
执行力则确保判决能够切实得到执行，维护法律的权威性和严肃性。
2.确认依据方面：
法院在判定房屋所有权归属时，会严格依据相关法律法规、充分的证据以及法定程序。
比如，会仔细审查购房合同，确认合同的签订是否符合法律规定，双方的权利义务是否明确；查看产权登记情况，了解房屋在相关部门的登记信息；审核出资证明，明确购房资金的来源和流向等，通过这些全面细致的审查来确定真正的所有权人。
3.公示公信角度：
虽然不动产物权变动通常以登记作为公示方法，但法院判决作为司法裁判的结果，具有强大的公信力。
即使房屋登记信息与实际情况不符，法院的判决也能确定房屋的真实权利状态，让公众可以信赖该判决所确定的所有权归属。
4.后续保障方面：
此判决能够作为后续办理房屋产权变更登记等手续的重要依据。
相关部门有义务协助执行，从而保障权利人的合法权益，确保权利人能够顺利地完成房屋产权的变更等相关事宜。

案情回顾:

小朱和小李就一处房屋的所有权产生纠纷，小朱主张自己是房屋所有权人，小李则认为房屋应归自己所有。双方争执不下，遂诉至法院。法院经审理后判决房屋归小朱所有，但小李对此判决结果存在异议，认为判决不合理。

案情分析:

1、从法定效力层面看，法院生效判决有既判力与执行力。既判力使双方不能就房屋所有权再争议，执行力保障判决能切实执行。
2、确认依据方面，法院会审查购房合同、产权登记及出资证明等，以确定真正所有权人，本案判决是基于充分证据和法定程序作出。
3、公示公信角度，即使登记不符实际，判决也能确定真实权利状态。
4、后续保障方面，此判决可作为产权变更登记依据，相关部门应协助执行。