办理公证后获取房本（也就是房屋所有权证或不动产权证书），通常有以下清晰明确的步骤：
一、准备材料
这是办理的基础环节。
首先，需要准备公证文书，不同情况对应不同的公证类型。
比如涉及房屋买卖时，需准备公证合同；若是房屋继承，则要准备继承公证等相关文书。
其次，身份证明必不可少，常见的如身份证、户口本等，这些能证明当事人的身份信息。
此外，还需准备相关税费缴纳凭证等，确保所有费用已按规定缴纳。
二、申请登记
在买卖的情况下，买卖双方需共同前往当地不动产登记部门，提出房屋所有权转移登记申请，并将准备好的材料一并提交。
而对于继承的情况，继承人要持继承公证书以及其他必要材料，到不动产登记部门申请办理房屋产权变更登记，明确房屋产权的归属变化。
三、审核与缴费
不动产登记部门会对申请材料进行严谨审核。
审核过程中，会仔细核对各项材料的真实性和完整性。
若符合条件，便会告知申请人需要缴纳的相关费用，比如常见的登记费等，让申请人清楚知晓费用明细。
四、领取房本
申请人在缴纳完费用后，只需按照不动产登记部门通知的具体时间和指定方式，就可以顺利领取新的房本，完成整个办理流程。

案情回顾:

小朱与小李签订房屋买卖合同并办理公证后，小朱按流程准备材料申请登记，缴纳相关税费后等待领证。但领证时，不动产登记部门称小朱提交的一份身份证明存在瑕疵，暂无法发证，小朱认为材料无问题，双方产生争议。

案情分析:

1、小朱需确认身份证明是否真的存在瑕疵。若瑕疵属实，应及时补充或更正材料，以满足登记部门的要求。
2、若小朱认为材料无误，可要求登记部门明确指出瑕疵所在，并提供相关依据。若登记部门无法给出合理说明，小朱有权要求其按流程发放房本。