做一张调整的凭证把科目合并，并在摘要栏，写上原因以备后面不好查证。
借一个科目贷一个科目就行（摘要写清楚），比如说一个科目其他应付款另一个科目应付账款，合并成应付账款，就借其他应付款贷应付账款就行了。
如果一个科目都是应付账款分开的明细帐合并，那就借应付账款—某某客户贷应付账款—某某客户。
以此类推。
如果属于同一明细科目，而且各自的余额正确无误，可能是重复新增科目造成的，可以将余额相加合并，同时，停用其中一个科目。

《公司法》。