不可以作为股东出资。
根据相关规定，商业特许经营权来源于特许人对于被特许人的授权，当特许人或被特许人将特许经营权作为出资转移到公司名下时，必须会引起特许经营法律关系中义务人如何履行义务、权利人如何行使权利，会破坏原来的特许经营秩序，所以，商业特许经营权不能作为股东出资用于注册公司。

《公司法》第二十七条
股东可以用货币出资，也可以用实物、知识产权、土地使用权等可以用货币估价并可以依法转让的非货币财产作价出资；但是，法律、行政法规规定不得作为出资的财产除外。
对作为出资的非货币财产应当评估作价，核实财产，不得高估或者低估作价。法律、行政法规对评估作价有规定的，从其规定。