核心的区别就是专利权的作用是保护知识产权的合法利用，垄断则是利用优势市场地位对他人经营行为的排斥和限制。
《专利法》第一条，为了保护专利权人的合法权益，鼓励发明创造，推动发明创造的应用，提高创新能力，促进科学技术进步和经济社会发展，制定本法。