寻衅滋事行为本身是违法的，但如果有对方的谅解书，在处理时会考虑到这一因素。
一般来说，司法机关会综合案件的具体情况进行考量。
在这种情况下，司法机关会审查寻衅滋事的情节严重程度、对对方造成的伤害及影响等。
如果寻衅滋事行为较为轻微，对方的谅解书可能会对量刑产生一定的影响，使得犯罪嫌疑人或被告人有可能获得从轻或减轻处罚。
例如，原本可能被判处一定期限的有期徒刑，因有谅解书，可能会在量刑幅度内予以下调，比如从三年左右调整为两年左右。
同时，司法机关也会确保整个处理过程的公正性和合法性，不会仅仅因为谅解书而忽视寻衅滋事行为的本质和危害。
如果寻衅滋事行为情节严重，即使有谅解书，也不能完全免除其法律责任，只是在量刑时会作为一个重要的参考因素，以体现法律的严肃性和公正性。
总之，对方的谅解书在寻衅滋事案件的处理中具有一定的作用，但不能改变该行为的违法性质。