违法捕捞水生类动物罪行的刑事立案标准主要涵盖以下内容：
在划定禁止捕捞区域、规定禁止捕捞期限内或采用禁止使用的捕捞工具及方法进行捕捞活动。
例如，采用炸毁鱼类栖息地、投放有毒物质、利用高压电流等严重破坏渔业资源的方式进行捕捞作业；
或者在禁止捕捞区域、禁止捕捞期限内进行捕捞活动，并且情节严重者。
情节严重通常是指非法捕捞水生类动物数量较多或者多次实施此类行为等情况。

《中华人民共和国刑法》第三百四十条
【非法捕捞水产品罪】违反保护水产资源法规，在禁渔区、禁渔期或者使用禁用的工具、方法捕捞水产品，情节严重的，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者罚金。