在被告拒绝承认其罪行且表示愿意接受处罚的情况下，法院将全面考虑所有证据以及相关事实并基于此作出裁决。
在此过程中，法院将仔细审阅案件中的各项证据，如书证、物证、证人证言、受害者陈述、犯罪嫌疑人、被告人供述及辩护、鉴定意见、勘验、检查、辨认、侦查实验等笔录、视听资料、电子数据等等，以此来确认被告人是否存在罪行以及该罪行的严重程度。
若被告人拒绝承认其罪行且表示愿意接受处罚，然而证据确凿、充分，能够排除合理怀疑，足以证明被告人有罪，那么法院仍然会依据法律规定作出有罪判决。
但是，如果证据不足以证明被告人有罪，则应遵循“疑罪从无”的原则，作出无罪判决。

《中华人民共和国刑事诉讼法》第五十五条
【重证据、重调查研究、不轻信口供原则】对一切案件的判处都要重证据，重调查研究，不轻信口供。只有被告人供述，没有其他证据的，不能认定被告人有罪和处以刑罚；没有被告人供述，证据确实、充分的，可以认定被告人有罪和处以刑罚。
证据确实、充分，应当符合以下条件：
（一）定罪量刑的事实都有证据证明；
（二）据以定案的证据均经法定程序查证属实；
（三）综合全案证据，对所认定事实已排除合理怀疑。