药店的工作人员若存在自购药物后进行倒卖的违规操作，此举无疑属于非法经营行为，依照相关法律规定，应由药品监管部门采取果断措施予以严厉打击，坚决取缔该等行为，同时对所有违法销售的药品及由此获利的收入进行严密清查并依法予以没收，此外还需处以所售药品价值数额两倍以上五倍以下的罚款。
若情节恶劣且构成刑法意义上的非法经营罪行，则将面临如下严格处置：一旦认定为情节较为严重者，应判处有期徒刑五年以下或拘役，同时处以或单处违法所得数额一倍以上五倍以下的罚金;
而对于情节严苛者，刑期将升至五年以上，并且需要处以违法所得数额一倍以上五倍以下罚金或者直接没收财产。

《刑法》第二百二十五条
违反国家规定，有下列非法经营行为之一，扰乱市场秩序，情节严重的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金；情节特别严重的，处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或者没收财产：
（一）未经许可经营法律、行政法规规定的专营、专卖物品或者其他限制买卖的物品的；
（二）买卖进出口许可证、进出口原产地证明以及其他法律、行政法规规定的经营许可证或者批准文件的；
（三）未经国家有关主管部门批准非法经营证券、期货、保险业务的，或者非法从事资金支付结算业务的；
（四）其他严重扰乱市场秩序的非法经营行为。