擅自改变武器装备编配用途罪的认定标准如下：
1、侵犯的客体是武器装备的管理秩序；
2、在客观方面表现为违反武器装备管理规定，擅自改变武器装备的编配用途，因而造成严重后果的行为；
3、主体为特殊主体；
4、主观方面即行为人应当预见自己的行为违反了武器装备管理规定，会造成严重后果，由于疏忽大意而没有预见，或者已预见又轻信能够避免，以致发生严重后果。

《刑法》第四百三十七条
违反武器装备管理规定，擅自改变武器装备的编配用途，造成严重后果的，处三年以下有期徒刑或者拘役；造成特别严重后果的，处三年以上七年以下有期徒刑。