1、主体不同：申请执行是当事人向人民法院申请强制执行，强制执行是人民法院决定适用强制执行的程序和措施。
2、法律效果不同：申请执行只是申请人向法院已提交的保护自身利益的申请。强制执行则是法院根据当事人的申请而做出的有效方法来保证申请人的利益。
《民法典》第八条，民事主体从事民事活动，不得违反法律，不得违背公序良俗。

《商务行政处罚程序规定》第五十一条
当事人逾期不履行行政处罚决定的，作出行政处罚决定的商务主管部门依法强制执行或者申请人民法院强制执行。
申请人民法院强制执行前，可以向当事人发出要求其履行义务的书面催告。催告发出10日后当事人仍未履行的，申请人民法院强制执行。