司机运输冻肉是否会被拘留以及拘留的天数，这得依据具体的情形来判别。
首先来看冻肉来源合法的情况，当司机只是在进行正常的运输作业，并非有意为之，这种情况下，通常是不会被拘留的。
因为司机只是在履行自己的运输职责，没有违法的主观故意。
然而，要是冻肉属于走私物品这类违法货物，而司机明明知晓却参与运输，那么就有可能构成走私罪的共犯。
要是情节比较轻微，那么司机会被判处三年以下的有期徒刑或者拘役；要是情节较为严重，刑期则会在三年以上十年以下。
还有一种情况，假如司机是被他人欺骗而运输违法的冻肉，并且有确凿的证据能够证明这一点，那么在量刑时可以根据实际情况酌情从轻处罚。
关于具体的拘留天数，这是无法确切给出的，因为它要根据案件的实际状况、犯罪情节的轻重以及司法机关的裁量等多方面因素来确定。
不同的案件情况差异很大，所以不能一概而论地给出一个固定的拘留天数。

案情回顾:

小朱是一名司机，受雇运输冻肉。运输过程中被查获，争议点在于小朱是否知晓冻肉来源违法。若冻肉合法，小朱正常运输；若冻肉走私，小朱明知参与运输则涉走私罪；若小朱被骗运输违法冻肉，量刑或可从轻。

案情分析:

1、若冻肉来源合法，小朱正常履行运输职责，无违法主观故意，通常不会被拘留。
2、若冻肉为走私物品且小朱明知参与运输，构成走私罪共犯。情节轻微，处三年以下有期徒刑或拘役；情节严重，处三年以上十年以下有期徒刑。
3、若小朱被骗运输违法冻肉且有证据证明，量刑可酌情从轻，具体拘留天数需综合案件实际情况等确定。