在大多数情况下，职务侵占罪的诉讼程序均由人民检察院发起进行。
本罪名严重触犯了公司、企业或其他相关单位之财产利益，进一步损害了社会经济领域中的正常秩序，因此被定性为公共性质的诉讼案件。
检察院有权在诉讼中代表国家抗辩，通过追究被告人的刑事责任来维护公众利益。

《中华人民共和国刑事诉讼法》第三条
【职权原则严格遵守法定程序原则】对刑事案件的侦查、拘留、执行逮捕、预审，由公安机关负责。检察、批准逮捕、检察机关直接受理的案件的侦查、提起公诉，由人民检察院负责。审判由人民法院负责。除法律特别规定的以外，其他任何机关、团体和个人都无权行使这些权力。
人民法院、人民检察院和公安机关进行刑事诉讼，必须严格遵守本法和其他法律的有关规定。