在案件中，如果犯罪嫌疑人无罪，则应当撤销案件。
假如犯罪嫌疑人已经遭到逮捕，那么就须立即将之释放，向其发放释放证明文件，并及时通知原审批逮捕的检察机关。
尽管其涉嫌违反组织纪律以及国家法律的行为后果严重，但是仅仅是处于“怀疑”阶段，尚未确定为既定事实，因此与刑事惩罚之间并不存在直接的因果关系。
只有在经过深入细致的调查取证工作后，证实其违法行为的证据确凿无疑，方能依据法律规定对相关当事人进行相应的处罚。

《刑事诉讼法》第一百六十三条，在侦查过程中，发现不应对犯罪嫌疑人追究刑事责任的，应当撤销案件；
犯罪嫌疑人已被逮捕的，应当立即释放，发给释放证明，并且通知原批准逮捕的人民检察院。