若非法运营车辆遭遇交通事故，根据相关规定及保险合同的约定，保险公司将依照具体项目及金额进行赔偿。
《机动车交通事故责任强制保险条例》明文规定，当被保险机动车在道路上发生交通事故，导致除该机动车驾驶人、被保险人和车上其他人员之外的其他人遭受人身伤害或财产损失时，由保险公司依据本条例在机动车交通事故责任强制保险责任限额范围内承担相应赔偿责任。
然而，如果道路交通事故的损失系由受害人故意行为所致，则保险公司有权拒绝赔偿。

《机动车交通事故责任强制保险条例》第二十一条
被保险机动车发生道路交通事故造成本车人员、被保险人以外的受害人人身伤亡、财产损失的，由保险公司依法在机动车交通事故责任强制保险责任限额范围内予以赔偿。
道路交通事故的损失是由受害人故意造成的，保险公司不予赔偿。