关于货物运输保险纠纷问题的正确处理方式有以下几种：
首先，可以通过双方协商的方式来妥善解决合同纠纷。
其次，如果双方都愿意的话，也可以在独立于双方之外的第三方机构的主持下，借助其积极引导，促使双方达成友好的和解协议。接下来，如果合同中已经预先设定了仲裁条款或者双方自愿达成了仲裁协议，那么就可以根据相关法律法规，对合同中的争议事项进行公正合理的居中裁决。
最后，如果以上所有途径都无法解决问题，那么诉讼便是解决纠纷的最终手段。

《中华人民共和国仲裁法》第二条
平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷，可以仲裁。
《民事诉讼法》第三条
人民法院受理公民之间、法人之间、其他组织之间以及他们相互之间因财产关系和人身关系提起的民事诉讼，适用本法的规定。