当车辆发生非法改装后，保险公司往往不能对其进行赔偿。这主要是因为，非法改装可能导致保险标的物所面临的风险显著增加，致使保险人有权提高保费或取消保险合同。
根据相关法律法规的明确规定，在保险合同有效期内，如保险标的物的风险程度有所上升，则被保险人应按照合同约定及时通知保险人。在此基础上，保险人将根据具体情况决定是否调整保费水平或取消保险合同。

《中华人民共和国保险法》第五十二条
在合同有效期内，保险标的的危险程度显著增加的，被保险人应当按照合同约定及时通知保险人，保险人可以按照合同约定增加保险费或者解除合同。保险人解除合同的，应当将已收取的保险费，按照合同约定扣除自保险责任开始之日起至合同解除之日止应收的部分后，退还投保人。
被保险人未履行前款规定的通知义务的，因保险标的的危险程度显著增加而发生的保险事故，保险人不承担赔偿保险金的责任。