关于货运车辆运营证件未进行年度审查而导致发生交通事故后保险公司是否应予以理赔，依据相关法规，若驾驶员尚未取得驾照或存在醉酒驾车、保险机动车辆在被盗窃或抢夺期间发生事故以及被保险方故意引发道路交通事故等情况时，保险公司可不承担赔偿责任。
然而，除上述情形之外，只要没有事先与保险公司达成免赔协议，保险公司均需对受害者的财产损失负责赔偿。

《机动车交通事故责任强制保险条例》第二十二条
有下列情形之一的，保险公司在机动车交通事故责任强制保险责任限额范围内垫付抢救费用，并有权向致害人追偿：
（一）驾驶人未取得驾驶资格或者醉酒的；
（二）被保险机动车被盗抢期间肇事的；
（三）被保险人故意制造道路交通事故的。
有前款所列情形之一，发生道路交通事故的，造成受害人的财产损失，保险公司不承担赔偿责任。