当两份判决书出现冲突时，法院会按照法律规定及司法程序妥善处理，具体情况如下：
1.审查判决书合法性与关联性：法院会仔细核查两份判决书。
比如，查看判决所依据的证据是否充分、程序是否符合法律要求、与案件本身的关联性是否紧密等。
若其中一份存在程序违法，像未依法通知当事人参与庭审，或者适用法律错误，如对法律条款理解偏差导致错误判决，这份判决书就可能被撤销或变更。
2.考虑判决作出时间：法院会关注两份判决书作出的先后顺序，通常以较后的判决书为准。
因为后续判决可能是基于新的证据或对法律更准确的理解作出的。
若两份判决书作出时间相近，法院则要深入审查案件事实和法律适用情况。
在整个处理过程中，法院始终遵循司法公正、合法合理的原则，切实保障法律的正确实施以及当事人的合法权益。

案情回顾:

小朱和小李因合同纠纷先后有两份判决书，出现冲突。一份判决存在未依法通知小朱参与庭审的程序违法问题，另一份在法律条款理解上有偏差。且两份判决作出时间相近，争议点在于应以哪份为准以及违法判决如何处理。

案情分析:

1、对于存在程序违法，如未通知当事人参与庭审的判决书，因其违反法定程序，损害了当事人的诉讼权利，法院可能会依法撤销或变更该份判决书。
2、由于两份判决书作出时间相近，法院需要深入审查案件事实和法律适用情况，遵循司法公正、合法合理原则，综合判断后确定以更符合法律规定和事实的判决为准，保障当事人合法权益。