对于一次性被扣除12分的机动车驾驶员来说，其处理流程主要分为以下几个部分：
首先，驾驶员必须在收到吊销通知之日起15个自然日内，向机动车驾驶证核发地或者实施吊销行为所在地的公安机关交通管理部门进行报备，然后参加为期七日且覆盖范围包括道路交通安全法律、法规及相关知识等方面的集中学习和培训。
完成这个阶段的学习之后，驾驶员需要接受由公安机关交通管理部门组织的道路交通安全法律、法规的理论测试，也就是我们所熟知的科目一考试。
如果顺利通过了考试，那么之前的积分将会消除，同时返还机动车驾驶证给驾驶员；但若是未能通过，那么需要重新参与学习与培训，并且参加下一轮的考试。
另外，如果驾驶员在一个计分周期内已经累计达到了12分或者曾有过累计两次达到12分的情况，除需参加科目一考试之外，还需要额外参加道路驾驶技能考试（科目三）。
值得一提的是，在处理这些违规行为时，驾驶员需要携带好个人身份证明（如身份证）、驾驶证以及车辆行驶证，并按照规定缴纳相应数额的罚款。
关于具体操作的详细信息，建议您咨询当地的交管部门为准。

《机动车驾驶证申领和使用规定》
第六十八条机动车驾驶人在一个记分周期内累积记分达到12分的，公安机关交通管理部门应当扣留其机动车驾驶证。
机动车驾驶人应当在十五日内到机动车驾驶证核发地或者违法行为地公安机关交通管理部门参加为期七日的道路交通安全法律、法规和相关知识学习。机动车驾驶人参加学习后，车辆管理所应当在二十日内对其进行道路交通安全法律、法规和相关知识考试。考试合格的，记分予以清除，发还机动车驾驶证;考试不合格的，继续参加学习和考试。拒不参加学习，也不接受考试的，由公安机关交通管理部门公告其机动车驾驶证停止使用。