营运车辆在被扣押期间，其损失的承担方通常是扣车方。
倘若因为执法部门依法执行公务而致使车辆被扣押，通常情况下，应当由执法部门来承担因扣车而引发的合理损失，像车辆处于停运状态期间的合理运营收益损失等这类情况。
然而，要是由于当事人自身的原因导致车辆被扣押，例如交通违法未进行处理等，那么相应的损失就需要由当事人自己来承担。
在实际的操作过程中，要确定具体的损失承担方，就必须依据扣车的原因、相关的法律法规以及具体的案件实际情况来进行准确的判断。
倘若对于营运车辆在被扣押期间的损失承担问题出现了争议，当事人是可以通过法律途径来寻求解决办法的，向相关的责任方主张要求其赔偿损失。
这样既能够保障当事人的合法权益，也能确保在处理这类问题时有法可依、公平公正。