有。

补偿协议只要各方当事人认可协议内容、自愿签署，就具有法律效力。

《民法典》第四百六十五条，依法成立的合同，受法律保护。
依法成立的合同，仅对当事人具有法律约束力，但是法律另有规定的除外。