关于分公司的债权债务纠纷所涉及的管辖法院问题，依照我国《中华人民共和国民事诉讼法》（以下简称“民诉法”）的相关法律规定进行明确。
一般而言，此类案件通常应由被告方所在居住地的法庭进行审判和裁决。
但是在合同协议履行地位于原告所处地区时，原告亦有权选择将诉讼提交至其所在地区内的法庭处理，这同样符合法律程序和规定。
需要特别提醒的是，分公司并不具备独立的法人资格，因此在涉及到其民事责任承担方面，其所有的经济负担皆由作为上级领导的总公司进行承担。
因此在特殊情况下，法院对于总公司所在地的争议或纠纷处理也拥有合法的管辖权力。

《中华人民共和国民事诉讼法》第二十二条
对公民提起的民事诉讼，由被告住所地人民法院管辖；被告住所地与经常居住地不一致的，由经常居住地人民法院管辖。
对法人或者其他组织提起的民事诉讼，由被告住所地人民法院管辖。
同一诉讼的几个被告住所地、经常居住地在两个以上人民法院辖区的，各该人民法院都有管辖权。