申请支付令和起诉的区别为：适用的情形不同，程序不同，法律结果不同，概念不同，申请的条件不同等。
申请支付令是债权人向法院提出申请，让法院向债务人发出支付令，督促债务人履行给付金钱或有价证券的一种特殊程序，而起诉则是当事人就民事纠纷向人民法院提起诉讼，请求人民法院依照法定程序进行审判的行为。

《中华人民共和国民事诉讼法》第二百二十一条
债权人请求债务人给付金钱、有价证券，符合下列条件的，可以向有管辖权的基层人民法院申请支付令：
（一）债权人与债务人没有其他债务纠纷的；
（二）支付令能够送达债务人的。
申请书应当写明请求给付金钱或者有价证券的数量和所根据的事实、证据。