如果能证明房屋所有权就算没有房产证也能获得赔偿。
如果不能认定为违章建筑，又没有房屋产权证的话，还是可以获得适当的补偿的，一般是参照建筑成本进行补偿，可能就比合法有效的房子补偿的少得多，具体金额根据当地评估才能得出。

《国有土地上房屋征收与补偿条例》第二十五条
房屋征收部门与被征收人依照本条例的规定，就补偿方式、补偿金额和支付期限、用于产权调换房屋的地点和面积、搬迁费、临时安置费或者周转用房、停产停业损失、搬迁期限、过渡方式和过渡期限等事项，订立补偿协议。
补偿协议订立后，一方当事人不履行补偿协议约定的义务的，另一方当事人可以依法提起诉讼。