商铺租赁税费征收的标准是：
月租金收入低于20000元的，免征营业税；
月租金收入高于20000元的，按照5%的税率，缴纳营业税。同时缴纳城建税、教育费附加、防洪费和地方教育附加。
租赁管理费和房屋租赁税都是以租金为基础，按照一定的标准组织征收。

《民法典》第二百九十条
《中华人民共和国税收征收管理法》第三十五条
纳税人有下列情形之一的，税务机关有权核定其应纳税额：
（一）依照法律、行政法规的规定可以不设置帐簿的；
（二）依照法律、行政法规的规定应当设置帐簿但未设置的；
（三）擅自销毁帐簿或者拒不提供纳税资料的；
（四）虽设置帐簿，但帐目混乱或者成本资料、收入凭证、费用凭证残缺不全，难以查帐的；
（五）发生纳税义务，未按照规定的期限办理纳税申报，经税务机关责令限期申报，逾期仍不申报的；
（六）纳税人申报的计税依据明显偏低，又无正当理由的。
税务机关核定应纳税额的具体程序和方法由国务院税务主管部门规定。