农村集体土地的承包协议通常由乡镇街道层面的经济管理统计站进行妥善保存，这显然是属于合同管理的重要环节之一。
同时，作为当地行政单位的村委员会亦理应协助备份并保管相关文件。对于具体的承包协议而言，承包方亦会持有其中的一份。实际上，承包协议正是涵盖了相关的承包合同条款内容。甲方代表着村委会的法律地位，乙方则是相应的承包户。
依据合同约定，甲乙双方必须各自保留一份完整的协议文档以备查验。

根据《农村土地承包经营权证管理办法》第十条规定，农村土地承包经营权证登记簿、承包合同登记及其他登记材料，由县级以上地方农业行政主管部门管理。
农村土地承包方有权查阅、复制农村土地承包经营权证登记簿和其他登记材料。县级以上农业行政主管部门不得限制和阻挠。