当医疗司法鉴定结果医院不认可时，有以下几种处理方式。
一方面，医院在规定的时间范围内能够申请重新鉴定，不过这需要满足法定的条件，像是出现了能够对原先鉴定结论产生重大影响的新证据之类的情况。
另一方面，医患双方可以一同委托上一级的医学会来进行再次鉴定。
倘若双方没办法在再次鉴定这件事上达成一致意见，那么就可以向法院提起诉讼，由法院来指定具有相应资质的鉴定机构开展鉴定工作。
在诉讼的整个过程当中，各方都应该充分地准备好相关的证据，像原先的鉴定报告以及与之相关的病历资料等，以此来支撑自己的主张。
并且，一定要留意鉴定程序的合法性以及公正性，只有这样才能够保证鉴定结果的客观真实。
总而言之，必须要通过合法的途径去解决对医疗司法鉴定结果所产生的争议，从而切实维护好自身的合法权益。