医疗事故鉴定费用支付方式如下：
当事人向卫生行政部门申请鉴定的费用由申请的当事人支付；
双方当事人共同委托的，由双方当事人共同支付，事后证明是医疗事故的由医疗机构承担支付费用，不是医疗事故的由患者承担费用。

《医疗事故处理条例》第三十四条医疗事故技术鉴定，可以收取鉴定费用。
经鉴定，属于医疗事故的，鉴定费用由医疗机构支付；
不属于医疗事故的，鉴定费用由提出医疗事故处理申请的一方支付。
鉴定费用标准由省、自治区、直辖市人民政府价格主管部门会同同级财政部门、卫生行政部门规定。