在婚姻关系中，一般来说，分居三年是可以单方面申请离婚的。
按照我国的法律规定，当夫妻因为感情不和而分居满了二年，并且经过调解也无法挽回感情的，这种情况下就应该准许离婚。
像分居三年，刚好就达到了法律所规定的分居年限要求。
要是再通过法律诉讼的方式，把分居的相关证据提交给法院，像是分居协议、证人的证言之类的，然后由法院进行审理。
如果法院经过审理，认定夫妻之间的感情确实已经破裂了，那就会作出判决，准许离婚。
不过这里得注意，法院判决离婚的关键标准是夫妻感情是否真的已经破裂了，仅仅只是分居了三年，可并不一定就能肯定地判决离婚，还得综合考虑其他很多方面的因素来进行判断。