关于农村房屋争议问题如何妥善解决，提供以下几点参考建议：首先，应尽量促成当事人双方进行友好的协商；其次，若双方无法达成一致意见，可考虑向当地政府相关职能部门提出调解申请；再者，如调解未果，也可选择提交至仲裁委员会进行仲裁裁决；最后，在以上途径均无法解决问题时，还可寻求法律援助，通过法院司法程序来解决争端。值得注意的是，根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》第二十五条之规定，房屋征收部门与被征收人应当依据该条例的具体要求，就补偿方式、补偿金额及支付期限、用于产权调换房屋的位置和面积、搬迁费用、临时安置费用或周转用房、停产停业损失、搬迁期限、过渡方式以及过渡期限等关键事宜，签订书面的补偿协议。一旦补偿协议签署生效，任何一方违反协议约定的义务，另一方可依法提起诉讼维护自身权益。

《国有土地上房屋征收与补偿条例》第二十五条房屋征收部门与被征收人依照本条例就补偿方式、补偿金额和支付期限、用于产权调换房屋的地点和面积、搬迁费、临时安置费或者周转用房、停产停业损失、搬迁期限、过渡方式和过渡期限等事项，订立补偿协议。补偿协议订立后，一方当事人不履行补偿协议约定的义务的，另一方当事人可以依法提起诉讼。