具体而言，若是行为人以不合规的种子替代正规种子，导致农业生产由此承受了相当程度的经济损失，那么对此类犯罪行为，通常应判处三年以下有期徒刑或拘役，并依照实际销售额数额的50%以上、2倍以下罚款。
而当它所带来的后果更为严重，使得农业生产遭受了重大损失之时，则应当判处被告人三年以上、七年以下的有期徒刑，同时也要在实际销售额数额的50%以上、2倍以下对其进行罚款的刑事处罚。

《刑法》第一百四十七条
生产假农药、假兽药、假化肥，销售明知是假的或者失去使用效能的农药、兽药、化肥、种子，或者生产者、销售者以不合格的农药、兽药、化肥、种子冒充合格的农药、兽药、化肥、种子，使生产遭受较大损失的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处销售金额百分之五十以上二倍以下罚金；使生产遭受重大损失的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处销售金额百分之五十以上二倍以下罚金；使生产遭受特别重大损失的，处七年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处销售金额百分之五十以上二倍以下罚金或者没收财产。