面对公司进行的非法集资活动，公司员工有资格进行辩护，但是必须明确的是，如果这些员工在知晓犯罪行为的情况下仍然积极地参与其中，那么他们就必须依法为此负起相应的法律责任。
具体而言，如果这个员工是这种骗局的积极参与者，那么他/她将会被归类为集资诈骗罪的共犯，因此需要自身承担相应的刑事责任；
相反的，假如这个员工仅仅是普通员工或者仅仅是一般的参与者，那么通常情况下，他们不会因为这次事件而被追究刑事责任。

《刑事诉讼法》第十一条
人民法院审判案件，除本法另有规定的以外，一律公开进行。被告人有权获得辩护，人民法院有义务保证被告人获得辩护。
第十四条
人民法院、人民检察院和公安机关应当保障犯罪嫌疑人、被告人和其他诉讼参与人依法享有的辩护权和其他诉讼权利。
诉讼参与人对于审判人员、检察人员和侦查人员侵犯公民诉讼权利和人身侮辱的行为，有权提出控告。