1、虚报注册资本罪在客观方面并不一定存在虚假出资行为，而虚假出资罪则必定存在虚假出资行为。
2、在是否骗取公司登记机关方面不同。虚报注册资本罪的行为人必定要实施欺骗公司登记机关的行为。虚假出资罪中的行为人由于虚假出资不是为了骗取公司登记，因而不会去欺骗公司登记机关，而只是欺骗其他公司发起人、股东或者债权人，比如将虚假的验资证明交给其他股东，谎称已足额出资。两罪在客观方面的这种差别，使得虚报注册资本罪侵犯的是公司登记管理制度，虚假出资罪侵犯的却是其他公司发起人、股东或者债权人利益。
3、在虚假出资的具体表现上有所不同。虚报注册资本罪中的虚假出资行为可以表现为出资不足额。虚假出资罪在客观方面则不包括这种虚假出资行为。
4、两罪的犯罪主体有所不同。虚假出资罪的主体是公司发起人和股东，虚报注册资本罪的主体是申请公司登记的人。当然，实践中，公司发起人和股东可能同时又是申请公司登记的人，但并非所有公司发起人和股东同时又是申请公司登记的人。

《刑法》第一百五十九条
公司发起人、股东违反公司法的规定未交付货币、实物或者未转移财产权，虚假出资，或者在公司成立后又抽逃其出资，数额巨大、后果严重或者有其他严重情节的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处虚假出资金额或者抽逃出资金额百分之二以上百分之十以下罚金。
单位犯前款罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，处五年以下有期徒刑或者拘役。