倘若犯罪嫌疑人被指控涉及运输毒品罪行，但他坚持否认这一指控，那么司法机构将依法根据已经掌握确凿的证据开展案件审理并做出相应裁决。
在法律执行过程中，犯罪嫌疑人的陈述固然是重要的证据来源之一，但却绝非判定案件结论的唯一依据。
若其他证据充足且具有充分可信度，能构建起一个完整的证据链条，足以证实犯罪嫌疑人确实实施了运输毒品的违法行为，即便犯罪嫌疑人矢口否认，也无法改变对其实施罪责定夺和裁量刑罚的结果。
根据我国现行的《中华人民共和国刑事诉讼法》规定：对于所有案件的审判，都应重视证据的重要性，注重调查研究的深度，而不是轻信他人的仅口头陈述。
唯有被告人如实交代自己的罪行，但缺乏其他任何证据支持的情况下，才不能认定被告人有罪并予以判刑；
反之，如无被告人的供述，但证据确凿、充分，同样可以认定被告人有罪并予以判刑。
然而，证据确凿、充分的标准必须满足以下几个方面：
（1）定罪量刑的事实都应有证据加以证明；
（2）作为定案依据的证据都需经过法定程序严格审查核实；
（3）综合全案证据，对所认定的事实应排除一切合理的怀疑。

《中华人民共和国刑事诉讼法》第五十五条
【重证据、重调查研究、不轻信口供原则】对一切案件的判处都要重证据，重调查研究，不轻信口供。只有被告人供述，没有其他证据的，不能认定被告人有罪和处以刑罚；没有被告人供述，证据确实、充分的，可以认定被告人有罪和处以刑罚。
证据确实、充分，应当符合以下条件：
（一）定罪量刑的事实都有证据证明；
（二）据以定案的证据均经法定程序查证属实；
（三）综合全案证据，对所认定事实已排除合理怀疑。