需要缴税，因为客户违约而收取的合同违约金，是甲公司的收入，既然是收入，那就必须计入应纳税所得额，计算缴纳企业所得税。
这2万元是甲公司因为客户违约而取得收入，不是支出，是不能扣除的。

依据《中华人民共和国个人所得税法》等相关法律规定。