未经公安备案的公章合同是有效的。在签订合同时，只要企业不违反有关规定和其他禁止性法律法规的有关规定，就是双方真实意思的表达，是有效的合同。合同生效不需要公章备案。但在公司注册过程中，一般需要办理公章备案手续，以便如遇假盖或私刻公章，可报案主张无效，因此公章未备案存在较高的法律风险，为了公司资金账户的安全，建议去备案。
公司法规定公司公章由谁管理?
（一）这是公司自治范围，即公司股东会决议决定由谁保管。一般来说公章由法定代表人保管，所以导致现实中很多法定代表人被罢免后，把公司公章、帐册都带出公司，公司和法定代表人为争夺公章而诉诸法庭，甚至诉诸武力抢夺公章。
（二）公司公章是公司对外意思表示的载体，具有证明和确定公司主体资格和能力的法律效果，公司当然拥有其公章的所有权。依照法律或者法人组织章程规定，代表法人行使职权的负责人，是法人的法定代表人。
（三）尽管法律没有规定公司的公章由谁管理，司法实践和现实中都倾向认为公章由法定代表人持有，或者公司股东会、董事会决议授权的人持有。

《中华人民共和国民法典》第四百九十条当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。在签名、盖章或者按指印之前，当事人一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。法律、行政法规规定或者当事人约定合同应当采用书面形式订立，当事人未采用书面形式但是一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。
《印章治安管理办法》第十条需要刻制印章的单位应当到公安机关批准的刻制单位刻制;刻制单位将刻制的印章向公安机关办理印鉴备案后，方准启用。
第七条国家权力、党政、司法、参政议事、军队、武警、民主党派、共青团、工会、妇联等机关、团体的各级组织、机构需要刻制印章的，由制发机关的印章管理部门开具公函到所在地县级以上人民政府公安机关办理备案手续。县级以上人民政府公安机关应即办理并出具准刻证明。