1、夫妻分居期间可以主张孩子的抚养费。抚养子女是父母的法定义务，必须履行，和父母是否离婚无关。
2、抚养费是父母或其他对未成年人负有抚养义务的人，为未成年人承担的生活、教育等费用。我国法律上的抚养费，是指当这些人不能充分履行或不履行抚养义务时，支付给未成年人的费用。

《民法典》第一千零五十八条规定，夫妻双方共同承担对未成年子女抚养、教育和保护的义务。
《民法典》第一千零六十七条第一款又进一步明确规定，父母不履行抚养义务的，未成年子女或者不能独立生活的成年子女，有要求父母给付抚养费的权利。因此，在男女双方婚姻分居期间，一方未能对子女尽到抚养义务的，另一方有权要求该方承担给付分居期间的抚养费。
如果一方提出离婚的诉讼请求获得了法院的支持，那么除了可以获得分居期间孩子的抚养费补偿外，还可以主张不直接抚养孩子的一方每月承担相应的抚养费。
如果一方提出离婚的诉讼请求未能获得法院支持，那么除了分居期间的抚养费外，分居期间持续的，则不直接抚养孩子的一方仍应当继续支付抚养费。