关于农村房屋争议的妥善处理，首要步骤应为涉事双方展开理性且公正的磋商谈判；若无法达成共识，则可寻求乡镇人民政府的协助和调解以求问题得以妥善解决。倘若对乡镇人民政府所做出的处理决定持异议者，自收到处理决定书面通知之日起算，三十天内有权向上一级人民法院提出诉讼申请。在此期间，任何人皆不得随意变动房屋现状。对于涉及到国家机关、企事业单位等机构间的争议事宜，由县级及以上行政级别负责处理和协调。

《中华人民共和国民法典》第二百三十三条物权受到侵害的，权利人可以通过和解、调解、仲裁、诉讼等途径解决。《中华人民共和国土地管理法》第十六条土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决；协商不成的，由人民政府处理。单位之间的争议，由县级以上人民政府处理；个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。在土地所有权和使用权争议解决前，任何一方不得改变土地利用现状。