办理食品公司注册的流程如下：
1、准备公司名称到工商局核名；
2、到刻章厂刻章一套分为公章、财务章、法人章、合同章；
3、工商局办理营业执照；
4、到公司所在地的质量技术监督局办理公司组织机构代码证；
5、国税局办证处办理国税证；
6、地税局办证处办理地税；
7、公司的会计准备材料国地税务分局办理公司备案跟报税等事项。

《公司法》第六条
设立公司，应当依法向公司登记机关申请设立登记。符合本法规定的设立条件的；
由公司登记机关分别登记为有限责任公司或者股份有限公司；不符合本法规定的设立条件的，不得登记为有限责任公司或者股份有限公司。
法律、行政法规规定设立公司必须报经批准的，应当在公司登记前依法办理批准手续。公众可以向公司登记机关申请查询公司登记事项，公司登记机关应当提供查询服务。