关于违约金的具体计算方式，往往依照合同所约定的比例进行计算。
以4万元人民币作为标的金额，按照5%的比率进行计算，则其违约赔偿金应为：
40000×5%=2000元。
实际应用过程中，法律对违约金的设定原则上要求合理、公平。
如遇约定的违约金过高或是过低，当事人有权向法院或仲裁机构申请进行适当的调整。
然而，从通常情况来看，只要合同系由双方自愿签署，且违约金的设定并未违反法律法规中的强制性规定，便应当严格按照约定履行。
因此，在签署合同时，关于违约金事项的条款需谨慎审定与协商。