在大多数情况下，拥有土地使用权证书而无房产所有权证书的建筑物遭遇拆迁时，相关部门通常会基于实际状况及多方因素进行全面评估并确定补偿方案。
若此种建筑的修建过程符合法律法规规定，仅仅由于各种原因导致未及时获得房产证照，则往往会参照具备相应资质证书的房屋予以补偿。
常见的补偿方式涵盖了货币补偿以及房屋产权置换等多样化选择。
然而，倘若这类建筑物存在非法加盖或其他违建行为等问题，其补偿情况极有可能因此受到影响。

《国有土地上房屋征收与补偿条例》第十七条
作出房屋征收决定的市、县级人民政府对被征收人给予的补偿包括：
（一）被征收房屋价值的补偿；
（二）因征收房屋造成的搬迁、临时安置的补偿；
（三）因征收房屋造成的停产停业损失的补偿。
市、县级人民政府应当制定补助和奖励办法，对被征收人给予补助和奖励。