在离婚案件中，农村自建房的判决通常遵循这样的原则。
当房屋是婚后建造的，并且双方没有对房屋的归属做出特殊约定时，通常会被认定为夫妻共同财产。
在离婚的时候，双方可以先尝试进行协商处理。
要是协商不成，法院就会依据房屋的具体情况，比如房屋的面积、位置、装修情况等，还有双方在建造房屋过程中的出资情况等因素来做出判决。
假如有一方主张房屋的所有权，那么就需要拿出证据来证明自己的出资等情况。
而另一方则需要根据自己应得的份额来进行补偿。
要是房屋是婚前由一方建造的，并且登记在这一方的名下，一般就会被认定为这一方的个人财产，在离婚的时候是不参与分割的。
但是，如果另一方在房屋建造过程中出了资或者有其他的贡献，那么就可以主张相应的补偿。
总之，对于农村自建房在离婚案件中的判决，需要综合考虑各种因素，以确保判决的公平合理，既不会让一方受到不合理的损失，也能保障另一方的合法权益。