若司法机构正式接手处理职务侵占犯罪案件之后，首先需要遵循特定的程序展开深入的调查工作，严格搜集与之相关的各类证据，其中包括但不限于各种实物证据、文件资料以及能证明案件情况的证人供词及陈述等等。
如果历经重重环节所获取到的证据足以证实犯罪行为的存在，那么就将会立即提交给检察院，请其依据相关法律法规进行严格的案件审查，倘若该项审查确认符合提起公诉条件，那么法院便会依据既定的司法程序进行法理上的严肃审慎审理。
在这一阶段的审理过程中，还需要根据具体案情安排法庭调查、法庭辩论等各个环节，综合考虑涉及的案件事实真相、所获得的证据以及相关法律条例，从而对于该案件作出合法合理的判决。
如若最终判定涉案被告人为犯罪分子，那么将要依照我国《中华人民共和国刑法》中所规定的内容：“任何人利用自己在公司、企业或其他组织中的职务权力，将本应属于公共财产的部分据为私有，且经查实其侵占数额已经达到相当数额的话，则应当受到相应的刑事追究。
根据相关法律规定，此类犯罪行为的量刑标准如下，即在贪污数额较小的情况下，将面临三年以下有期徒刑或者拘役，同时还要缴纳罚金；
而当贪污数额较大时，则将面临三年以上十年以下有期徒刑，同样也要缴纳罚金；
至于贪污数额特别巨大者，则将面临十年以上有期徒刑甚至是无期徒刑，并且仍需缴纳罚金。
”在此基础之上，还需要对其施以相应的刑罚，并要求其退还所有非法所得。

《中华人民共和国刑法》第二百七十一条
【职务侵占罪；贪污罪】公司、企业或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；数额巨大的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；数额特别巨大的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金。
国有公司、企业或者其他国有单位中从事公务的人员和国有公司、企业或者其他国有单位委派到非国有公司、企业以及其他单位从事公务的人员有前款行为的，依照本法第三百八十二条、第三百八十三条的规定定罪处罚。